مهمترین نقطه قوت این سازمان وجود توانمندی و مهارت های عظیم در اعضای سازمان و ازسوئی دیگر مهمترین نقطه ضعف آن، چالش های ساختاری می باشد.وجود یک بخش فعال حقوقی مسلط به قوانین،برای بازنگری و تطبیق دائمی آئین نامه ها و بخشنامه های صادره از وزارت راه و شهرسازی و مراجع صدور پروانه ساختمانی و شوراهای اسلامی و شورای مرکزی کشور و هیات مدیره سازمان استان ها و نیز سازمان بازرسی،با قوانین نظام مهندسی و مدنی کشور و بروزرسانی آن ها بیش از پیش احساس می گردد.
از دیگر نقاط قوت این سازمان فراگیر شدن رعایت مقررات ایمنی و بهداشتی و کاهش خسارات حین ساخت و هنگام بهره برداری از ساختمان ها بوده که این امر با تعامل و تفاهم فی ما بین شرکت های بیمه و وزارت تعاون و کار و امور اجتماعی با سازمان نظام مهندسی و حمایت های شایسته و همه جانبه وزارت راه و شهرسازی جهت حمایت از شاغلان صنعت ساختمان و     جامعه بعنوان بهره برداران و ذینفعان،میسر گردیده است.
ارتقاء سطح دانش فنی و مهارت های استادکاران و کارگران ماهر در این حوزه با همکاری سازمان فنی و حرفه ای کشور از دیگر خدمات ارزنده این سازمان می باشد.
چالش های سازمان نظام مهندسی
1)ممانعت از ورود افراد غیرمتخصص و فاقد صلاحیت در صنعت ساختمان که سبب گشت مهندسان نتوانند تجربه و دانش خود را به نحو احسن در ساخت و سازها اعمال نمایند.
2)حمایت موثر از ورود تکنولوژی های جدید و صنعتی سازی فرآیندهای ساخت.
3)لزوم تدابیر قانونی جهت ایجاد شفاف سازی در خصوص عملکرد مسئولیت نظام مهندسی
4)تاثیرگذاری قوی و حمایت از اعضای حقوقی و حقیقی که بصورت واقعی و نه صوری صنعت ساختمان فعالیت می نمایند و افزایش روحیه کارحرفه ای و گروهی
5)وجود مغایرت های زیاد بین مشخصات مندرج در پروانه ساختمان و ساختمان های اجرا شده، عدم حمایت مراجع قانونی از مهندسان سبب ایجاد دغدغه خاطر و اتلاف انرژی بسیار زیاد همکاران محترم می گردد.
6)فعالتر نمودن روابط عمومی سازمان جهت افزایش آگاهی و تشویق کارفرمایان، مالکان و بهره برداری ساختمان ها برای استفاده بیشتر از خدمات مهندسان و هم چنین بکارگیری استادکاران ماهرتر و استفاده از مصالح ساختمانی استاندارد و باکیفیت.
7)عدم وجود چک لیست های نظارت بر ساختمان ها که مهندسان ناظر بتوانند با نظم بیشتر در غالب سیستمی از پیش تعیین شده به ارائه خدمات فنی بپردازند.
8)تخصیص بودجه کافی به واحدهای کنترل و نظارت سازمان و افزایش تعداد بازدیدها از ساختمان های در حال اجرا.
9)انتخاب اشخاص شایسته در کمیسیون های تخصصی سازمان.

و کلام آخر اینکه از مهندسان بعنوان متخصصین و فرهیختگان جامعه انتظار می رود با همت والا و استفاده از تجربیات ارزشمندشان نسبت به ترغیب و تشویق دیگر فعالان صنعت ساختمان به تشکیل انجمن های تخصصی،صنفی و حرفه ای اهتمام ورزند.علیرضا محسنی ساروی